• Introducción


    • El curso “Programación Para las Ciencias Biológicas” trata sobre el estudio y uso de herramientas computacionales que permiten automatizar de manera confiable los procesos de exploración, análisis, comparación y manipulación de cadenas de los ácidos nucleicos usando BASH, R y PYTHON a través del Paradigma Pedagógico Ignaciano.

      El uso de líneas de comandos en el análisis de secuencias biológicas con BASH, R y Python es importante debido a su capacidad para automatizar tareas repetitivas, garantizar la reproducibilidad de los resultados, brindar acceso a librerías especializadas y facilitar el análisis remoto. Además, las líneas de comando pueden combinarse para crear secuencias complejas de instrucciones que permiten analizar datos en múltiples niveles y manejar diferentes tipos de secuencias.

      RESULTADOS DE APRENDIZAJE

      RDA 1: Desarrollar algoritmos con lenguaje de programación estructurado de línea de comandos para secuencias biológicas

      • Criterio de evaluación 1: Programar algoritmos para la automatización de tareas de análisis de secuencias de ADN o ARN en línea de comandos
      • Criterio de evaluación 2: Construir soluciones para el manejo eficiente de archivos con secuencias de ADN o ARN
      • Criterio de evaluación 3: Aplicar algoritmos que mejoran el rendimiento de scripts en la ejecución de tareas relacionadas con el análisis de secuencias de ADN o ARN

      RDA 2: Desarrollar algoritmos con lenguajes de programación multiparadigma para secuencias biológicas.

      • Criterio de evaluación 1: Programar algoritmos para el análisis de secuencias biológicas con un enfoque multiparadigma
      • Criterio de evaluación 2: Integrar técnicas estadísticas en el análisis de secuencias biológicas
      • Criterio de evaluación 3: Construir métodos de procesamiento eficientes de grandes volúmenes de secuencias biológicas

      RDA 3: Utilizar bibliotecas especializadas en bioinformática para cálculos fundamentales de bases nitrogenadas.

      • Criterio de evaluación 1: Emplear bibliotecas bioinformáticas para la conversión de secuencias de ADN a ARN
      • Criterio de evaluación 2: Calcular los parámetros asociados con la composición de bases nitrogenadas
      • Criterio de evaluación 3: Construir operaciones básicas de manipulación de secuencias con bibliotecas bioinformáticas